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谷歌算法解读酶活性
2019-01-08 | 编辑: | 【 】| | 供稿部门:规划战略与信息中心
    

  2018年12月10日《美国科学院院刊》报道,耶鲁大学研究者采用了一种新的方法来解开酶的复杂结构和调控机制——谷歌搜索。研究者利用谷歌算法PageRank识别了调节大多数微生物必需的细菌酶的关键氨基酸。

  酶可以加速生命必需的化学反应,这些化学反应通常发生在酶的活性位点,但反应的加速必须由酶的不同部分协同调节,其中底物结合位置称为变构位点。几十年的研究仍未弄清楚底物是如何从变构位点转移到活性位点的,主要困难在于涉及的原子数量多且酶结构的灵活性大。

  研究者注意到,在计算机科学领域,类似的问题早在几年前就已得到解决。谷歌的研究人员研究了互联网上的信息流,使用PageRank来表示每个网页在链接到其他网站的数量和质量方面的重要性。酶的问题也类似于遥远地点之间的信息交换,通过发现每个原子的信息如何随着变构激活剂变化而与酶结合,就有可能找到被激活的信息通道。研究人员在大多数微生物的细菌酶——咪唑甘油磷酸酯合酶(imidazole glycerol phosphate synthase,IGPS)中发现了重要的氨基酸。这项研究为与IGPS活性相关的其他实验铺平了道路,有助于开发新的抗生素、杀虫剂和除草剂。

  研究者表示,这项研究令人兴奋的是,数据科学方法开始渗透到理论化学领域,与最先进的分子动力学模拟和核磁共振方法相结合,为理解催化分子系统提供了新的工具。

 

信息来源:http://www.gzu521.com/app/20190118/8al.html

 

 
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